Malacidin xuất hiện để có được cấu hình hoạt động của chúng sau khi chúng liên kết với canxi; các phân tử kết hợp canxi sau đó xuất hiện để ràng buộc với lipid II, một phân tử tiền thân của tế bào vi khuẩn, dẫn đến phá hủy thành tế bào và vi khuẩn sẽ chết.[2][5] Vì vậy, chúng sẽ là một thành viên mới của lớp kháng sinh phụ thuộc vào canxi.[6] Phát hiện của malacidin ủng hộ quan điểm cho rằng kháng sinh phụ thuộc canxi là một lớp lớn hơn trước đây nghĩ.